رفع اشکال درس بیوشیمی مخصوص رشته بیوتکنولوژی
- نویسنده موضوع saharandishe
- تاریخ شروع
tkia
New member
من تو کتاب لودیش دیدم که موتیف رو جز ساختمان دوم و دمین رو جزء ساختمان سوم قرار داده و در توضیح موتیف گفته که عملکرد مشترکی بین پروتیینهای مختلف داره ودر توضیح دمین گفته فعالیت خاص اون پروتئین را نشون میده حتی اگه از بقیه اون پروتئن جدا شده باشه،اما بازم فرقشونو متوجه نمیشم:14:
دقیقا منظور منم همین بود
ساختمان دوم شامل مارپیچ آلفا، صفحه بتا، حلقه(loop)، پیچ(turn)، ... هست
ترکیبی از 2 یا 3 تا از ساختارهای بالا رو میگن موتیف، که موتیف رو جزء ساختار فوق دوم حساب میکنن (ولی فک کنم جزء ساختار سوم هم حساب بشه)، مثل مارپیچ-حلقه-مارپیچ که توی کالمودولین دیده میشه
به نواحی مجزای ساختار سوم پروتئین، دمین میگن. مثلا تو ساختار میوزین یه دومن کروی داریم (سر میوزین) و یه دومن رشته ای (دم میوزین) ... که حالا اون کالمودولین که بالا گفتم یه زیرمجموعه ای از دومن کروی میوزین هست
ترکیبی از 2 یا 3 تا از ساختارهای بالا رو میگن موتیف، که موتیف رو جزء ساختار فوق دوم حساب میکنن (ولی فک کنم جزء ساختار سوم هم حساب بشه)، مثل مارپیچ-حلقه-مارپیچ که توی کالمودولین دیده میشه
به نواحی مجزای ساختار سوم پروتئین، دمین میگن. مثلا تو ساختار میوزین یه دومن کروی داریم (سر میوزین) و یه دومن رشته ای (دم میوزین) ... که حالا اون کالمودولین که بالا گفتم یه زیرمجموعه ای از دومن کروی میوزین هست
elissa 2
New member
سلام. میدونم که از روش های کالریمتریک از نوع cooper base
وقتی یون مس تو محیط قلیایی با پروتئین تشکلی کمپلکس میده ،احیا میشه بعد الکترونی که گرفته رو به یون مولیبدات (تو معرفی به نام فولین فنل) منتقل میکنه .
یه رنگ ابی تولید میشه که به کمک اسپکت تو طول موج 750 نانومتر غلظت پروتئین رو نشون میده.
اساسش شبیه بورته( تو بورت معرف فولین فنل نداریم) اما حدود ده مرتبه از بورت حساس تره.
protein to protein variation کمی هم داره بنابراین قابل اعتماده اما مداخله گر زیاده داره، و چون به صورت برگشت ناپذیر پروتئین رو دناتوره میکنه و نگه داری معرفاش سخته کمتر استفاده میشه
alireza-ja
New member
منظورم از آنزیم همون سوبسترا بود
)))))اعصاب نمیذارن واس آدم
چجوریاس که سرعت ماکس تحت تاثیره ؟
alireza-ja
New member
منظورم از آنزیم همون سوبسترا بود
اعصاب نمیذارن واس آدم
چجوریاس که سرعت ماکس تحت تاثیره ؟
والا دقیقا متوجه منظورتون نیستم . خوب شما هر چقدر مقدار آنزیم رو زیاد کنید خوب سرعت بالا میره. حالا هر کدوم از آنزیمها یه میل ترکیبی به سوبسترا دارن که ثابته و شما چه یه سوبسترا چه هزار سوبسترا بهش بدید این آنزیم حرص و طمعش برای سوبسرا یه اندازه هستش.
The Guy
Well-known member
خب با افزایش غلظت آنزیم ، مقدار کمپلکس آنزیم-سوبسترا هم بیشتر میشه، پس سرعت کلی واکنش هم بیشتر میشه.
منظورتون از این سوال اینه که km و vmax که با هم در تناسب هستن (معادله میکایلیس)، چرا وقتی اون میره بالا این ثابته؟!
فکر کنم چون من کتاب اصلی رو نخوندم و به ضروریات اکتفا کردم یه سری از مفاهیم برام جا نیفتاده
چیزی که من برداشت کردم اینه که سرعت ماکس ثابته .. نباید تغییر کنه .. اون چیزی که با کم و زیاد شدن غلظت آنزیم تحت تاثیر قرار میگیره ، سرعته ، نه سرعت ماکس
اگر اشکال جمله بالا گرفته شه احتمالا متوجه شمh34r-smiley:
چیزی که من برداشت کردم اینه که سرعت ماکس ثابته .. نباید تغییر کنه .. اون چیزی که با کم و زیاد شدن غلظت آنزیم تحت تاثیر قرار میگیره ، سرعته ، نه سرعت ماکس
اگر اشکال جمله بالا گرفته شه احتمالا متوجه شم
h34r-smiley:
آخرین ویرایش:
molecular9researcher
New member
درود دوستان .
سوالی داشتم چرا سرین با وجود گروه پروتون دهنده در آمینو اسید سرین منظور گروه آر .چرا این ریشه پی کا آر نداره؟؟؟؟؟؟
سوالی داشتم چرا سرین با وجود گروه پروتون دهنده در آمینو اسید سرین منظور گروه آر .چرا این ریشه پی کا آر نداره؟؟؟؟؟؟
alireza-ja
New member
سلام.
چون سرین الکل نوع اول هستش و الکل های نوع اول هم خیلی سخت واکنش میدهند به همین دلیل واسش pK R در نظر نگرفتن.
molecular9researcher
New member
tnx aaa looooooooooooooooot
molecular9researcher
New member
دوست عزیزم ببخشید نزر شما راجب این که سرین در واکنشای کاتالیتیک شرکت میکنه و هیدروژنش کنده میشه ولی در آخر واکنش دوباره بهش برمیگرده.چیه؟
alireza-ja
New member
بله سرین جز اسیدآمینه های کلیدی جایگاه فعال سرین پروتئازها مثل کیموتریپسین هستش. در بخشی از عملکرد آنزیم سرین هیدروژن الکلی خودش رو رها میکنه ولی حواستون باشه که pK ها رو چه 1 چه 2 و چه R رو بر اساس واکنش یونیزاسیون در شیب pH یعنی از کم به زیاد میسنجن. کنده شدن پروتون از سرین در جایگاه فعال آنزیم ها تحت تأثیر pH نیست بلکه بخاطر خاصیت الکتروفیلی اسید آمینه دیگری مثل هیتسیدین هستش که باعث کنده شدن پروتون میشه و این ربطی به pK نداره.
اگر چنین واکنشهایی رو هم مد نظر میگرفتن باید به ازای هر هیدروژن انواع اسید آمینه ها یک pK تعریف میکردن چون در هر ترکیبی هر پروتون تحت یک عامل کشنده، میتواند جدا شود؛ پس این مد نظر نیست.
اون قدرت کم الکل های گروه اول که گفتم مربوط به واکنشهایی مثل همین قرار گرفتن در محیط اسیدی و سایر واکنشهای دیگه هستش.
آخرین ویرایش:
molecular9researcher
New member
با سپااااااس فراوان استفاده کردم دوست عزیز
