نحوه محاسبه بار پپتید

[hasti69]

لطفاهرکدومتون روش محاسبه بارپپتیدزیرو بلده باراه حلش برام توضیح بدید؟باتشکر
Glu-His-Trp-Ser-Tyr-Gly-Leu-Arg-Pro-Gly

 

[sina.mb89]

به طور کلی برای حل اینگونه مسائل باید به 2 دسته از اسید آمینه ها توجه شود:
1- اسیدآمینه هایی با بار مثبت : لیزین،آرژنین،هیستیدین
2- اسیدآمینه هایی با بار منفی : آسپارتات و گلوتامات
در این سوال یک عدد گلوتامات داریم که می شود 1- و 2 عدد آرژنین و هیستیدین که می شود2+.پس بار کلی این پلی پپتید می شود 1+

 

[alireza-ja]

البته در صورت سوال باید بگه در چه pHی باید حساب کنیم. اگه منظور pH فیزیولوژیک باشه بله +1 میشه.

 

[hasti69]

ممنون ازجوابهاتون
متاسفانه فراموش کردمphمدنظرم3هست

 

[alireza-ja]

توی ph سه بارش +2 میشه.

 

[hasti69]

ممنون اگه میشه لطف کنیدنحوه محاسبه اشوبگید،باتشکر

 

[shoeleh.]

بچه ها به نظرتون +3 نمیشه؟ چون در ph=3 گروه آمین اسیدآمینه اول زنجیره یعنی glu به صورت nh3+ در میاد.

 

[alireza-ja]

لطفاهرکدومتون روش محاسبه بار پپتیدزیرو بلده باراه حلش برام توضیح بدید؟باتشکر
Glu-His-Trp-Ser-Tyr-Gly-Leu-Arg-Pro-Gly

توی این رشته گروههای زیر میتونن در یونیزاسیون شرکت کنند:
گروه کربوکسیل گلایسین انتهایی
گروه آمین گلوتامات ابتدای زنجیره
گروه کربوکسیل زنجیره جانبی گلوتامات ابتدایی زنجیره
گروه آمین زنجیره جانبی هیستیدین
گروه آمین زنجیره جانبی آرژنین.

در pH=3 گروههای زیر وضعیت زیر رو دارند:

گروه کربوکسیل گلایسین انتهایی : چون pK1 گلایسین زیر 3 هستش، پس دپروتونه میشه: -COO (یک بار منفی)

گروه آمین گلوتامات ابتدای زنجیره: چون pK2 گلوتامات بالای 3 هستش، پس شکل پروتونه داره: NH3+ (یک بار مثبت)

گروه کربوکسیل زنجیره جانبی گلوتامات ابتدایی زنجیره: چون pKR گلوتامات بالای 3 هستش (4.25)، پس شکل پروتونه داره: COOH (بدون بار)

گروه آمین زنجیره جانبی هیستیدین: چون pKR هیستیدین بالای 3 هستش پس شکل پروتونه داره، NH+ (یک بار مثبت)

گروه آمین زنجیره جانبی آرژنین: چون pKR هیستیدین بالای 3 هستش پس شکل پروتونه داره، 2NH+ (یک بار مثبت)

سه بار مثبت داریم با یک بار منفی که در کل میشه 2+

من اینطوری حلش کردم بقیه هم نظر خودشون رو بدن

 

[alireza-ja]

بچه ها به نظرتون +3 نمیشه؟ چون در ph=3 گروه آمین اسیدآمینه اول زنجیره یعنی glu به صورت nh3+ در میاد.

آخه گروه کربوکسیل انتهایی مربوط به گلایسن هم دپروتونه میشه و بار منفی داره و یکی از بارهای مثبت رو خنثی میکنه.

 

[hasti69]

جواب2+جواب تسته ولی راه حلشوننوشته

 

[marry]

میشه +2.....

 

[marry]

ببینید تو این مساله هایی که بار پپتیدو میخوان باید NH2 ازادو در نظر گرفت نه NH . پس بار هیستیدین تو این پپتید صفره.چون NH داره.Glu اول 1 بار + داره چون Ph محیط از Ph گلوتامات کمتره و محیط براش اسیدیه پس به تعداد Nh2 ازاد بار مثبت داره.6 تا اسید امینه بعدی بارشون صفره چون نه NH2 ونه COOH ازاد دارن. محیط برای Arg هم اسیدیه پس بار اونم میشه+1. بار Pro هم صفره. و اما gly...محیط براش اسیدیه و گلایسین عامل آمین آزاد نداره پس بارش صفره.( عامل کربوکسیلش آزاده) پس کلا دو تا اسید امینه بار 1+ دارن که مجموعشون میشه 2+
امیدوارم متوجه شده باشین