پرایمر دژنره

abtin13

New member
از دوستان کسی در مورد "پرایمر دژنره - degenerate primer" اطلاعاتی داره؟ این که چی هستش و مورد استفاده اش کجاست؟
 
از دوستان کسی در مورد "پرایمر دژنره - degenerate primer" اطلاعاتی داره؟ این که چی هستش و مورد استفاده اش کجاست؟

سلام
ببینید پرایمر degenerateکاربردش برای پیدا کردن یک توالی خاص که در یک ارگانیسم در یک گونه وجود دارد ولی در یک ارگانیسم از یک گونه دیگه مشخص نیست بخصوص مثلاً توی یوکاریوت تعیین شده و لی توی یک گونه پرو کاریوت مشخص نشده!مثلاً یک توالی کد کننده یک آنزیم خاص!بکار می رود و از توالیهای wobbleاستفاده میشود در طراحی پرایمر، مثلاً یک توالی forward پی سی آر به اینصورت طراحی میشهATGCCGGTAAATATAGGCC(A/G)TTGC(A/T/C/G اون پرانتزیها میشه WOBBLE یعنی متغیر است یعنی در این جایگاهها پی سی آر هر تعداد باز رو که در یک جایگاه ما مشخص کردیم رو در نظر میگیره بجای یک باز ثابت و معمولاً برنامه پی سی آر متفاوتی داره واسه اینکه این توالیها رو مشخص کند و برنامه های طرحی پرایمر میشه سپرد که اینگونه طراحی کند ضمناً نیاز به جستجوی در سایتهای بیوانفورماتیک هم برای طراحی پرایمر نیاز است.نمیدونم چقدر مفید بوده پیروز باشید
پیروز باشید
 

e-arab

New member
علاوه برا توصیحات قبلی اگه اطلاعات شما فقط از توالی پروتینی باشد و توالیdnaدر دسترس نباشه هم باید برای طراحی پرایمر چندین حالت پرایمر در نظر بگیرید چون که بعضی از اسید های آمینه چندین رمز ژنتیکی دارند و برای ساخت پرایمر باید همه این رمز ها در نظر گرفته شود
 
بالا