فرق موتیف و دومن چیه؟

vahid28

New member
سلام
کسی میدونه فرق دومن با موتیف چیه؟
میشه دوتاشو توضیح بدید؟:riz304:
 

مجید دیجی

مدیر بخش
جملت رو کامل بنویس.
موتیف ساختاری داریم و موتیف رشته ای و موتیف دی ان ای و موتیف باکتریایی

یکمی توضیح بده کجا با این کلمه برخورد داشتی

اما موتیف در بیوشیمی : در پلیمرهای زیستی مانند پروتئین و یا اسید نوکلئیک، موتیف ساختاری یک فوق ساختار دوم است که در بسیاری از مولکول های دیگر نیز دیده میشود .

اما در کل یه چیز تو مایه های مارپیچ و پیچ خوردن و اینجور چیزاست .



اگه میتونی دومن رو انگلیسیش رو بنویس .
 

vahid28

New member
ً...........

موتیف ساختمان دوم و domain
توضیح کامل بدی ممنونم میشم
یزدیم عزیز
 

مجید دیجی

مدیر بخش
خیلی خوب
منظورتون توی بیوشیمی هست .
موتیف آرایش ساده ای است از ترکیب مارپیچ آلفا ، صفحه بتا و پیچ بتا که در پروتئین های اتصالی به کلسیم و دی ان ای و... وجود دارد . این ساختار دارای انواع مختلفی است . مثل : مارپیچ-پیچ-مارپیچ ، رشته-پیچ-رشته و...
 
  • Like
واکنش‌ها[ی پسندها]: IL-2

مجید دیجی

مدیر بخش
تفاوتشون :1) موتیف در ساختار دوم است و دومین در ساختار سوم
2)دومین دارای ویژگی هایی هست که من جایی ندیدم برای موتیف نوشته باشند . مثل : عمدتا آبگریزاند ، سطح قطبی دارند استقلال نسبی دارند .
یه جورایی وجود دومین در ساختار سوم اجین هست و باید وجود داشته باشه . اما موتیف در پروتئین های اتصالی یافت میشه

خوب سواد نم کشیده من همینا رو میدونه اگر کسی اطلاعات بیشتری بگه...
 

vahid28

New member
دمت گرم
اگه سواد تو نم کشیده هست با این اطلاعات پس من تبخیر شده :)
 

مجید دیجی

مدیر بخش
اگه اشتباه نکنم چند تا موتیف میشه دومین.

اینجور هم میشه گفت...
چون موتیف ساختار دوم هست و دومن ساختار سوم . و به شکلی هم پوشانی داره... اما فک نکم یه قانون ثابت باشه حتما دومن از موتیف باشه...
اما اگر میتونید جملتون رو کامل کنید ... و کمی بیشتر توضیح بدید...
یه چیز دیگه این حرف شما یعنی با هم تفاوتی ندارند ؟ من یکمی گیج شدم... اگه میشه توضیح بدید
 

vahid28

New member
مدیرگروه دانشگاه ما یه خانم پاکستانی هست
دکترجاوید
دکتری بیوفیزیک یا بیوشیمی داره
الان زنگش زدم گفت:به زبان ساده موتیف ترکیبی از چند ساختمان دوم که با ایجاد ساختار ویژه باعث عملکرد خاصی میشن
دومین:ساختار سوم چندین دومین دارد عموما که بخش های فشرده ای هستند که توسط زنجیره اصلی پلی پپتید بهم وصل میشن و مستقلا فولدینگ رو انجام‌ میدن
 

مجید دیجی

مدیر بخش
خیلی خوب
عالی بود . بعضی وقتا مطالعه یک یا دو منبع نمیتونه جوابگو صد در صد باشه...
 

Dr.passtor

New member
دوستان جسارتاً اول خیلی خوب میشه که معادل فارسی اونارو بدونین و بعد تو ساختارا یاد بگیرین. اون موقع خیلی مفید میشه.
به زبان خیلی ساده موتیف یعنی ردیف و دومین یعنی منطقه، ناحیه.
 

doneshjoo

New member
اینجور هم میشه گفت...
چون موتیف ساختار دوم هست و دومن ساختار سوم . و به شکلی هم پوشانی داره... اما فک نکم یه قانون ثابت باشه حتما دومن از موتیف باشه...
اما اگر میتونید جملتون رو کامل کنید ... و کمی بیشتر توضیح بدید...
یه چیز دیگه این حرف شما یعنی با هم تفاوتی ندارند ؟ من یکمی گیج شدم... اگه میشه توضیح بدید

شاید یکی از بهترین تعریف هایی که من دیدیم این باشه:

A domain is a discrete structural unit that is assumed to fold independently of the rest of the protein and to have its own function. It can be composed of 20 or so amino acid residues to up to hundreds of them. Domains are made up of multiple secondary structure units (alpha helices, beta sheets, etc.) Most proteins are multi-domain. Folds are the core 3-D structures of domains. It is believed that only a few thousand folds exist. A beta-barrel is an example of a fold.

Motifs are short, conserved regions and frequently are the most conserved regions of domains. Motifs are critical for the domain to function - in enzymes, for example, they may contain the active sites. Another example of motifs would be muclear localization sequences.
یا به بیان دیگه

Motifs are structural characteristics and domains are functional regions (not necessarily related to size). In a protein, a particular arrangement of amino acids or secondary structure that can be found in other proteins (not necessarily evolutionarily related) can be called a motif. If that particular arrangement is related to some function (DNA or protein binding, catalytic, etc.) then it is a domain. For example, the leucine zipper motif is usually found as part of a dimerization domain in many transcription factors.​
 

آیشن

New member
یک پروتئین از ساختارهای اول, دوم, فوق دوم ,سوم و چهارم تشکیل شده است.ساختار اول همان توالی اسیدآمینه ای است ساختار دوم در اثر پیوندهای سای و فای ایجاد میشود که باعث انعطاف میشود.بعد ساختار فوق دوم شکل میگیرند در نهایت از کنار هم قرارگیری دمین ها ساختار سوم که ساختار عملکردی است شکل میگیرد ساختار سوم در اثر نیروهای آب گریز ایجاد می شود ودر نهایت ساختار چهارم حاصل ساختارهای سوم است که در اثر میانکنش های آب گریز ایجاد می شود.
اما فرق بین موتیف و دمین :دومین فولدینگ خاص خودش را دارد و در واقع مستقل از قسمتهای دیگر پروتئین تا می خورد و اگر از پروتئین جدا شود عملکرد خودش را حفظ میکند در واقع هر دومین عملکرد خاص خ.دش را دارد مثل nترمینال و cترمینال DNAپلیمراز Iاما موتیف عملکرد خاص خودش را دارد.عدهای معتقدند ساختار فوق دوم و موتیف یکسان هستند
 

kaaziwa

New member
نگا کن وحید جان
موتیف: موتیف یه فوق ساختار دوم ِ یعنی چندتا ساختار دوم مثل مارپیج آفا و صفحه بتا و اینا ... باهم ترکیب میشن و یه موتیف میسازن. مثلا hlh , hth , zfn , ...
اما دمین: به قسمتایی از ساختار سوم میگن دمین که هرکدوم یه عمل خاص و انجام میده مثلا دمین متصل شونده به dna که خودش از چندتا zfn یا hlh ساخته شده.
امیدوارم خوب توضیح داده باشم. موفق باشی
 
😍فراخوان کارشناسی ارشد 97 تمامی گرایش های علوم آزمایشگاهی]😍

#تدریس سلولی مولکولی لودیش


💯💯تدریس و مشاوره رایگان زیر نظر رتبه 6 ارشد علوم آزمایشگاهی، کارشناس ارشد از دانشگاه علوم پزشکی تهران💯💯


🔴 فوری فوری

♥️‌‌‌‌ فراخوان عمومی برای ارشدهای علوم آزمایشگاهی ها
💛 بیوتکنولوژی پزشکی
💜 ایمنی شناسی پزشکی
💗 ژنتیک پزشکی
♥️ هماتولوژی
💜بیوشیمی
💙باکتری شناسی
💛ویروس شناسی
💖انگل شناسی
♥️و سایر رشته های که در آزمون ارشد درس سلولی مولکولی دارن


😍😍خاص ترین کانال تلگرامی


🌹https://telegram.me/joinchat/AAAAAEMLbE8Dde2U6DBzkA

✌️✌️ راه و روش رتبه برتر شدن را فقط از یک رتبه برتر میتوان آموخت✌️✌️

♨️به جمع ما بپیوندید👇👇👇


🌹https://telegram.me/joinchat/AAAAAEMLbE8Dde2U6DBzkA
 

zoha asl

New member
ساختارهای فرا ثانویه شامل:
1.موتیف یا خمیدگی (fold):از کنار هم قرار گرفتن ساختمان های پایدار دوم و برهمکنش بین آنها ایجاد میشود.ساختمان سوم مشخص هم نداره.یه موتیف گاهی ممکنه شامل کل یه pr باشه البته اگر pr کوچک باشه در این صورت آن موتیف ساختمان سوم پیدا میکند اما اگر موتیف بخشی از یک pr بزرگ تک زنجیر باشد فاقد ساختار سوم مباشد
2.دمین:بخشی از pr هست که جداگانه تا میخورد و معمولا فعالیتش مستقل از دیگر بخش هاست و اگر از پروتئین هم جدا شود باز هم ساختمان فضایی و عملکرد خواهد داشت .
3.گلوبول گداخته:molten globule حالت حدواسط قبل از حالت native یا فولدشده است سطح انرژی آن از حالت فولد بیشتر و از غیر فولد کمتره.حین فولدینگ حدواسط های زیادی تشکیل میشه که این نوع از بین آنها کانفورماسیون نزدیک به حالت فولد دارد.پس ساختمان سوم مشخصی نداره ِگلوبول گداخته نتیجه ی میانکنش بین دمین هاست.محتوی بالایی از ساختمان های دوم
 
بالا