علاوه برا توصیحات قبلی اگه اطلاعات شما فقط از توالی پروتینی باشد و توالیdnaدر دسترس نباشه هم باید برای طراحی پرایمر چندین حالت پرایمر در نظر بگیرید چون که بعضی از اسید های آمینه چندین رمز ژنتیکی دارند و برای ساخت پرایمر باید همه این رمز ها در نظر گرفته شود